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Designing Computational Biology Workflows with Perl
Conditional Remix & Share Permitted
CC BY-NC-SA
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This material introduces the AWS console interface, describes how to create an instance on AWS with the VMI provided, connect to that machine instance using the SSH protocol. Once connected, it requires the students to write a script to enter the data folder, which includes gene-sequencing input files and print the first five line of each file remotely. The same exercise can be applied if the VMI is installed on a local machine using virtualization software (e.g. Oracle VirtualBox). In this case, the Terminal program of the VMI can be used to do the exercise.

Subject:
Applied Science
Computer Science
Material Type:
Activity/Lab
Lecture Notes
Provider:
CUNY Academic Works
Provider Set:
Queensborough Community College
Author:
Esma Yildirim
Date Added:
06/04/2019
Designing Computational Biology Workflows with Perl
Conditional Remix & Share Permitted
CC BY-NC-SA
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This manual guides the instructor to combine the partial files of the virtual machine image and construct sequencer.ova file. It is accompanied by the partial files of the virtual machine image.

Subject:
Applied Science
Computer Science
Material Type:
Activity/Lab
Lecture Notes
Provider:
CUNY Academic Works
Provider Set:
Queensborough Community College
Author:
Esma Yildirim
Date Added:
06/04/2019
"Designing Computational Biology Workflows with Perl Part 2
Conditional Remix & Share Permitted
CC BY-NC-SA
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This material briefly reintroduces the DNA double Helix structure, explains SNP and INDEL mutations in genes and describes FASTA, FASTQ, BAM and VCF file formats. It also explains the index creation, alignment, sorting, marking duplicates and variant calling steps of a simple preprocessing workflow and how to write a Perl script to automate the execution of these steps on a Virtual Machine Image.

Subject:
Applied Science
Computer Science
Material Type:
Activity/Lab
Lecture Notes
Provider:
CUNY Academic Works
Provider Set:
Queensborough Community College
Author:
Esma Yildirim
Date Added:
06/04/2019
Designing Computational Biology Workflows with Perl Part 2b
Conditional Remix & Share Permitted
CC BY-NC-SA
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This material introduces the AWS console interface, describes how to create an instance on AWS with the VMI provided and connect to that machine instance using the SSH protocol. Once connected, it requires the students to write a script to automate the tasks to create VCF files from two different sample genomes belonging to E.coli microorganisms by using the FASTA and FASTQ files in the input folder of the virtual machine. The same exercise can be applied if the VMI is installed on a local machine using virtualization software (e.g. Oracle VirtualBox). In this case, the Terminal program of the VMI can be used to do the exercise.

Subject:
Applied Science
Computer Science
Material Type:
Activity/Lab
Lecture Notes
Provider:
CUNY Academic Works
Provider Set:
Queensborough Community College
Author:
Esma Yildirim
Date Added:
06/04/2019
Designing and Packaging a Distance-Sensing Product
Read the Fine Print
Educational Use
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Students begin by following instructions to connect a Sunfounder Ultrasonic Sensor and an Arduino Microcontroller. Once they have them set up, students calibrate the sensor and practice using it. Students are then given an engineering design problem: to build a product that will use the ultrasonic sensors for a purpose that they all specify. Students will have to work together to design and test their product, and ultimately present it to their classmates.

Subject:
Applied Science
Computer Science
Engineering
Mathematics
Measurement and Data
Physical Science
Physics
Material Type:
Activity/Lab
Provider:
TeachEngineering
Provider Set:
Activities
Author:
Kendra Randolph
Date Added:
11/29/2018
Designing the Digital World
Unrestricted Use
CC BY
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Short Description:
This book touches on design thinking, virtual reality, and 3D printing, and their applications in our world.

Long Description:
This book offers a blend of theory and practice in guiding readers to apply design thinking principles to solving some of our world’s biggest problems. At the same time, readers are encouraged to become aware of new and emerging technologies that make prototyping and applying solutions a reality.

Word Count: 38787

(Note: This resource's metadata has been created automatically by reformatting and/or combining the information that the author initially provided as part of a bulk import process.)

Subject:
Applied Science
Arts and Humanities
Career and Technical Education
Computer Science
Graphic Arts
Graphic Design
Visual Arts
Material Type:
Textbook
Date Added:
04/12/2021
Designing the Digital World
Unrestricted Use
CC BY
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The book offers a blend of theory and practice in guiding readers to apply design thinking principles to solving some of our world’s biggest problems. At the same time, readers are encouraged to become aware of new and emerging technologies that make prototyping and applying solutions a reality.

Subject:
Applied Science
Arts and Humanities
Computer Science
Information Science
Visual Arts
Material Type:
Textbook
Provider:
Open Press at NUI Galway
Author:
Eileen Kennedy
Date Added:
05/31/2021
Design of Ocean Systems
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CC BY-NC-SA
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This course covers the complete cycle of designing an ocean system using computational design tools for the conceptual and preliminary design stages. Students complete the projects in teams with each student responsible for a specific subsystem. Lectures cover such topics as hydrodynamics; structures; power and thermal aspects of ocean vehicles; environment, materials, and construction for ocean use; and generation and evaluation of design alternatives. The course focuses on innovative design concepts chosen from high-speed ships, submersibles, autonomous vehicles, and floating and submerged deep-water offshore platforms. Lectures on ethics in engineering practice are included, and instruction and practice in oral and written communication is provided.

Subject:
Applied Science
Computer Science
Engineering
Oceanography
Physical Science
Material Type:
Full Course
Provider:
MIT
Provider Set:
MIT OpenCourseWare
Author:
Chryssostomidis, Chryssostomos
Liu, Yuming
Date Added:
02/01/2011
Detecting Marine Debris - using Micro:bit
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CC BY-NC
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Project lesson plan involving detecting floating marine debris. Connections to the oceans' garbage patches.   Resource using Micro:bit and extension equipment to wire devices and Microsoft Makecode to code the Micro:bit to perform processes. Engineering Design Process is used to design a floating platform to hold and protect all equipment from water while it performs its functions.

Subject:
Computer Science
Electronic Technology
Engineering
Environmental Science
Oceanography
Material Type:
Activity/Lab
Author:
Marie Barber
Lauren Beal
Date Added:
08/05/2020
Dialogues on AI and Ethics: Case Study PDFs
Unrestricted Use
CC BY
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These are a set of fictional case studies that are designed to prompt reflection and discussion about issues at the intersection of AI and Ethics. These case studies were developed out of an interdisciplinary workshop series at Princeton University that began in 2017-18. They are the product of a research collaboration between the University Center for Human Values (UCHV) and the Center for Information Technology Policy (CITP) at Princeton. Click the title of each case study to download the full document.

Subject:
Applied Science
Arts and Humanities
Business and Communication
Career and Technical Education
Computer Science
Criminal Justice
Education
Health, Medicine and Nursing
Mathematics
Philosophy
Statistics and Probability
Material Type:
Case Study
Author:
Princeton Center for Information Technology Policy
Princeton University Center for Human Values
Date Added:
04/03/2024
Didacticiel de recherche en bibliothèque pour les sciences humaines et sociales
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CC BY-NC-SA
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Une introduction à la recherche informationnelle à l'Université de l'Alberta

Short Description:
Le but de ce manuel est de vous donner les connaissances de base nécessaires pour commencer à rechercher des informations en utilisant le catalogue et les bases de données de la bibliothèque de l’Université d’Alberta. Le manuel contient des instructions étape par étape, des vidéos et des exemples en sciences humaines et sociales. Pour atteindre les objectifs prévus, il vous faudra passer au moins une heure et demie à lire les instructions du didacticiel, répondre aux questions des exercices et revoir les exemples chaque fois que cela sera nécessaire.

Long Description:
This tutorial allows the learner to formulate a research question based on a humanities and social sciences topic, locate the full text of journal or book titles in the University of Alberta library, and ” identify references to inform your research question (s) using databases such as ERIC, Érudit and PsycInfo. A chapter is devoted to information evaluation and citation in APA format.

Word Count: 4828

ISBN: 978-1-55195-453-0

(Note: This resource's metadata has been created automatically by reformatting and/or combining the information that the author initially provided as part of a bulk import process.)

Subject:
Applied Science
Computer Science
Education
Higher Education
Material Type:
Textbook
Provider:
University of Alberta
Author:
Denis Lacroix et Sarah Shaughnessy
Date Added:
08/20/2020
Didacticiel du style de citation APA
Conditional Remix & Share Permitted
CC BY-NC-SA
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7e édition

Short Description:
Le didacticiel du style de citation APA est créé par le personnel de la bibliothèque de l'Université de l'Alberta pour venir en aide aux étudiants et aux professeurs. Le didacticiel explique pourquoi il est important de se servir de citations, des éléments relatifs à diverses sources courantes et comment créer des références et des citations dans le texte d’après les directives de la 7e édition du guide de l’APA. Une lecture assidue d'au moins une heure et demie est nécessaire pour atteindre les objectifs d'apprentissage. Ce didacticiel peut également servir de ressource de référence.

Long Description:
A l’origine le APA Citation Style Tutorial , sur lequel ce didacticiel est basé, a été créé par le personnel de la bibliothèque de l’Université de l’Alberta pour soutenir les étudiants et les professeurs dans les cours EDU 100/300 de la faculté d’éducation de l’Université de l’Alberta. Le didacticiel explique pourquoi il est important d’utiliser des citations, des éléments de types de source courants et comment créer des références et des citations dans le texte sur la base des directives APA de la 7e édition. Les sources et les activités tout au long du didacticiel se concentrent sur le contenu éducatif. Ce didacticiel peut également être utilisé comme ressource de référence. Le tutoriel de citation de style APA est une adaptation des didacticiels d’introduction à la APA de la NorQuest College Library. Ils ont fourni des ressources et un appui pour la création de ce didacticiel.

Word Count: 4261

ISBN: 978-1-55195-452-3

(Note: This resource's metadata has been created automatically by reformatting and/or combining the information that the author initially provided as part of a bulk import process.)

Subject:
Applied Science
Computer Science
Education
Material Type:
Textbook
Provider:
University of Alberta
Author:
Debbie Feisst
Denis Lacroix
Sarah Adams
Date Added:
04/01/2020
Didacticiel du style de citation Chicago Manual of Style, 17e Édition (méthode auteur-date)
Conditional Remix & Share Permitted
CC BY-NC-SA
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Short Description:
Ce didacticiel du style de citation Chicago est une adaptation du didacticiel d’introduction à la APA en français de la Bibliothèque de l’Université de l’Alberta. Il a été créé par le personnel de la bibliothèque de l'Université de d'Ottawa dans le but d'offrir une ressource en français aux étudiants et aux professeurs qui utilisent ce style dans leurs champs d'études et de recherches.

Long Description:
Le didacticiel discute de l’importance des citations et explique en détails les principaux éléments des références et des citations dans le texte d’après les directives de la 17e édition du manuel du style de citation Chicago. Une lecture en profondeur d’au moins une heure et demie est nécessaire pour atteindre les objectifs d’apprentissage. Ce didacticiel peut également être utilisé comme ressource de référence.

Word Count: 3025

(Note: This resource's metadata has been created automatically by reformatting and/or combining the information that the author initially provided as part of a bulk import process.)

Subject:
Applied Science
Computer Science
Education
Material Type:
Textbook
Provider:
University of Ottawa
Author:
Ann Hemingway
Catherine Lachaîne
Jennifer Dekker
Date Added:
01/01/2022
Didacticiel du style de citation Chicago Manual of Style, 17e édition (méthode auteur-date)
Conditional Remix & Share Permitted
CC BY-NC-SA
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Short Description:
Ce livre est une adaptation d’une oeuvre publié par la Bibliothèque de l’Université d’Ottawa créé au profit de la communauté du Campus Saint-Jean. Ce didacticiel discute de l’importance des citations et explique en détails les principaux éléments des références et des citations dans le texte d’après les directives de la 17e édition du manuel du style de citation Chicago. Une lecture en profondeur d’au moins une heure et demie est nécessaire pour atteindre les objectifs d’apprentissage. Ce didacticiel peut également être utilisé comme ressource de référence.

Long Description:
Ce livre est une adaptation d’une oeuvre publié par la Bibliothèque de l’Université d’Ottawa créé au profit de la communauté du Campus Saint-Jean. Ce didacticiel discute de l’importance des citations et explique en détails les principaux éléments des références et des citations dans le texte d’après les directives de la 17e édition du manuel du style de citation Chicago. Une lecture en profondeur d’au moins une heure et demie est nécessaire pour atteindre les objectifs d’apprentissage. Ce didacticiel peut également être utilisé comme ressource de référence.

Word Count: 3021

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Subject:
Applied Science
Computer Science
Education
Material Type:
Textbook
Provider:
University of Alberta
Author:
Sarah Shaughnessy
Date Added:
06/14/2022
Didacticiel du style de citation Chicago Manual of Style, 17e édition (méthode notes et bibliographie)
Conditional Remix & Share Permitted
CC BY-NC-SA
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Short Description:
Ce livre est une adaptation d’une oeuvre publié par la Bibliothèque de l’Université d’Ottawa créé au profit de la communauté du Campus Saint-Jean. Ce didacticiel discute de l’importance des citations et explique en détails les principaux éléments des références et des citations dans le texte d’après les directives de la 17e édition du manuel du style de citation Chicago. Une lecture en profondeur d’au moins une heure et demie est nécessaire pour atteindre les objectifs d’apprentissage. Ce didacticiel peut également être utilisé comme ressource de référence.

Long Description:
Ce livre est une adaptation d’une oeuvre publié par la Bibliothèque de l’Université d’Ottawa créé au profit de la communauté du Campus Saint-Jean. Ce didacticiel discute de l’importance des citations et explique en détails les principaux éléments des références et des citations dans le texte d’après les directives de la 17e édition du manuel du style de citation Chicago. Une lecture en profondeur d’au moins une heure et demie est nécessaire pour atteindre les objectifs d’apprentissage. Ce didacticiel peut également être utilisé comme ressource de référence.

Word Count: 2743

(Note: This resource's metadata has been created automatically by reformatting and/or combining the information that the author initially provided as part of a bulk import process.)

Subject:
Applied Science
Computer Science
Education
Material Type:
Textbook
Provider:
University of Alberta
Author:
Sarah Shaughnessy
Date Added:
06/14/2022
Didacticiel du style de citation Chicago Manual of style 17e édition (Méthode notes et bibliographie)
Conditional Remix & Share Permitted
CC BY-NC-SA
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0.0 stars

Short Description:
Ce didacticiel du style de citation Chicago est une adaptation du didacticiel d’introduction à la APA en français de la Bibliothèque de l’Université de l’Alberta. Il a été créé par le personnel de la bibliothèque de l'Université de d'Ottawa dans le but d'offrir une ressource en français aux étudiants et aux professeurs qui utilisent ce style dans leurs champs d'études et de recherches.

Long Description:
Le didacticiel discute de l’importance des citations et explique en détails les principaux éléments des références et des citations dans le texte d’après les directives de la 17e édition du manuel du style de citation Chicago. Une lecture en profondeur d’au moins une heure et demie est nécessaire pour atteindre les objectifs d’apprentissage. Ce didacticiel peut également être utilisé comme ressource de référence.

Word Count: 3537

(Note: This resource's metadata has been created automatically by reformatting and/or combining the information that the author initially provided as part of a bulk import process.)

Subject:
Applied Science
Computer Science
Education
Material Type:
Textbook
Provider:
University of Ottawa
Author:
Ann Hemingway
Catherine Lachaîne
Jennifer Dekker
Kahina Joseph
Date Added:
01/01/2022
Didacticiel sur le style de citation MLA (9e éd.)
Conditional Remix & Share Permitted
CC BY-NC-SA
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Short Description:
Ce livre est une adaptation d’une oeuvre publié par la Bibliothèque de l’Université d’Ottawa créé au profit de la communauté du Campus Saint-Jean. Le didacticiel explique l'importance de citer correctement diverses sources et de comprendre comment rédiger des citations et une liste des ouvrages cités selon les normes de la 9e édition du style MLA. Ce didacticiel peut également être utilisé comme outil de référence.

Long Description:
Ce livre est une adaptation d’une oeuvre publié par la Bibliothèque de l’Université d’Ottawa au profit de la communauté du Campus Saint-Jean. Le didacticiel explique l’importance de citer correctement diverses sources et de comprendre comment rédiger des citations et une liste des ouvrages cités selon les normes de la 9e édition du style MLA. Ce didacticiel peut également être utilisé comme outil de référence.

Word Count: 3103

(Note: This resource's metadata has been created automatically by reformatting and/or combining the information that the author initially provided as part of a bulk import process.)

Subject:
Applied Science
Computer Science
Material Type:
Textbook
Provider:
University of Alberta
Author:
Sarah Shaughnessy
Date Added:
07/19/2022
Didacticiel sur le style de citation MLA (9ᵉ éd.)
Conditional Remix & Share Permitted
CC BY-NC-SA
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Short Description:
Le didacticiel sur le style de citation MLA a été créé par le personnel de la bibliothèque de l’Université d’Ottawa pour aider aux étudiants et aux enseignants. Le didacticiel explique l’importance de bien citer des sources diverses et de comprendre comment rédiger des citations et une liste des ouvrages cités selon les normes de la 9ᵉ édition du style MLA. Ce didacticiel peut également servir d’outil de référence.

Word Count: 3072

(Note: This resource's metadata has been created automatically by reformatting and/or combining the information that the author initially provided as part of a bulk import process.)

Subject:
Applied Science
Computer Science
Material Type:
Textbook
Provider:
University of Ottawa
Author:
Jolene Hurtubise
Paul-Cezar Tanase
Téa Rokolj
Date Added:
01/01/2022